✅胃酸低下與胃食道逆流
有一個與傳統觀點相反的論述，認為胃食道逆流(GERD)是由於胃酸低下所引起的，並非是胃酸過多。這個論述認為，胃酸的分泌會隨年齡增加而減少，而胃食道逆流的發生率也會隨年齡增加而上升。幽門螺旋桿菌感染者也多有胃酸低下的情況。

胃酸的主要工作之一是防止胃以及小腸上部的細菌過度生長。因此胃酸低下會使細菌過度生長。
當小腸中的細菌過度增生時，會發酵碳水化合物產生氣體(氫氣或甲烷)。
氣體會增加腹部的壓力使胃中的酸進入食道，形成胃食道逆流。剛吃完食物就躺下，暴飲暴食或肥胖(腹部脂肪多)也都是腹部壓力增大的原因
胃酸低下會導致胰腺分泌不足，使碳水化合物的消化變差，進一步更惡化腸道環境，使小腸細菌增生，加重了胃酸逆流的症狀。

✅小腸細菌過度生長(SIBO) 與 IBS(腸躁症)
小腸細菌過度生長（SIBO）常見於IBS患者。 與結腸相比，小腸中細菌的數量很少。當細菌在小腸中過度生長時，會引起IBS症狀。包括：
噁心、氣脹、腹瀉、營養不良、減肥、賀爾蒙失衡、情緒波動、焦慮、疲勞

小腸比結腸更容易暴露於膽汁中。膽汁被分泌到十二指腸，進行脂肪的消化及吸收。當膽汁到達結腸時，95％的膽汁酸被重新吸收並送回肝臟進行再循環。
膽汁在腸道中的主要作用是脂肪/脂質的乳化。膽汁分解脂質，讓脂肪消化酶可以更好地進行分解。膽汁是兩親性物質，可親水也可親脂，可發揮類似於肥皂的洗滌作用。細菌的細胞膜是雙層脂質結構，膽汁的親脂性作用可將小腸中的細菌洗滌使細菌量維持於低水平。而人體細胞膜因為有膽汁酸轉運蛋白，所以不會被膽汁損害。優化肝膽功能可預防小腸細菌過度生長(SIBO)。